Η ακτινοθεραπεία μπορεί να προκαλέσει ανεπιθύμητες αντιδράσεις ή αλλιώς παρενέργειες οι οποίες διακρίνονται αναλόγως του χρόνου εμφάνισης σε οξείες και απώτερες.
 Οι παρενέργειες της ακτινοθεραπείας εξαρτώνται από την περιοχή της θεραπείας, την δόση της ακτινοβολίας, τη γενική κατάσταση του ασθενούς και τον συνδυασμό με άλλες και κυρίως με την χημειοθεραπεία.
 Οι οξείες παρενέργειες εμφανίζονται κατά τη διάρκεια της θεραπείας, είναι ήπιες και αυτοπεριοριζόμενες, δηλαδή αποδράμουν αυτόματα σε μικρό χρονικό διάστημα. Αναλόγως της περιοχής θεραπείας, μπορούν να αφορούν σε ερεθισμό του δέρματος, δυσουρικά ενοχλήματα και γαστρεντερικές διαταραχές. Άλλη οξεία παρενέργεια της θεραπείας είναι το αίσθημα κόπωσης.
 Οι απώτερες παρενέργειες, εμφανίζονται εβδομάδες ή και μήνες μετά το πέρας της θεραπείας, είναι σπάνιες και χρήζουν πολλές φορές λόγω σοβαρότητας, ειδικής αντιμετώπισης και αγωγής. Παραδείγματα απώτερων παρενεργειών είναι: η ίνωση, η μετακτινική κολίτιδα και κυστίτιδα.
 Η πιθανότητα εμφάνισης απώτερης τοξικότητας εξαρτάται από πολλούς παράγοντες, τόσο από πλευράς θεραπείας (ημερήσια και συνολική δόση ακτινοθεραπείας, χημειοθεραπεία) όσο και από παράγοντες από τον ασθενή, όπως γενετική επιβάρυνση, έξεις (π.χ. κάπνισμα).
 Ο Ιατρός σας θα ελέγξει προσεχτικά τους πιθανούς κινδύνους της θεραπείας με το αναμενόμενο όφελος (ίαση, σμίκρυνση όγκου, ανακούφιση συμπτωμάτων) και θα εφαρμόσει το καταλληλότερο θεραπευτικό σχήμα για την περίπτωσή σας.